气脉明点的作用
在金刚身的结构中，人的皮肤、肌肉、骨骼、大脑与修法没有直接联系，所以无需多费口舌。与修法直接相关的是气、脉、明点三者。
气、脉、明点有两方面的作用：第一个，是在没有证悟或没有修炼的时候，由气、脉、明点产生轮回；另外一个，是在修行成就以后，由气、脉、明点产生智慧，产生佛的刹土等一切清净现象，所以圆满次第是从气、脉、明点三个方面入手的。
气
气是什么呢？气有很多种，最粗大的最外在的是我们的呼吸。
由时轮金刚计算出的包括日食、月食等等在内的宇宙所有运动的基础数据得知，一个健康的中年人每天有21600次呼吸（一呼一吸算一个数），这样算下来，则每分钟有十五次呼吸。这个结果，与现代医学的观点基本吻合。
内在的气有十种：五种根本气，五种分支气。内在的某些气我们一般感觉不到，但实际上却是存在的。在世俗谛当中，这些气可以维持我们的身体，一旦这些气出了问题，或者是失去了，身体就会受到不同程度的影响。
密法讲过很多死亡的预兆，其中有些预兆出现在身体上，有些预兆出现在梦里，有些预兆出现在人的心态情绪上。
为什么会这样呢？因为，在人临近死亡的时候，首先气会出现问题——日渐衰竭，趋于停滞。虽然我们感觉不到，但由于气与精神是密切相关的，所以在身体的某些局部、梦境当中或者情绪上面就会出问题。虽然间隔死亡时间有时长一点有时短一点，但都是死亡的征兆。
深层次的密气，是指精神的运动，虽然阿赖耶识没有很明显的运动，但从阿赖耶识上面产生的精神却有着明显的波动——诞生、延续与灭亡，这种波动也叫气。
气还可以分为两种，业气与智慧气。
业气是指普通人的呼吸。有了呼吸的气流以后，就会让我们产生各种各样的烦恼或念头——善的念头、恶的念头、无记的念头，所有念头都与呼吸有着密切的内在关系，所以称之为业气。
智慧气也叫做智气，也即气（呼吸）当中产生智慧的那一部分。
脉
密法认为，在人体的脉当中，中脉是最关键的，其次是左脉与右脉，以及从三脉当中衍生出来的七万二千根大小不同的与修行相关的脉，另外还有一些与修行没有太大关系的脉。
然后是脉轮——分别位于头顶、喉间、心间、脐部与密处等等，按照不同的续部，而有五种脉轮、六种脉轮与七种脉轮等说法。
中脉分三种：存在中脉、法性中脉与胜义中脉。
存在中脉：意即客观存在的中脉。
为什么说它客观存在呢？密法讲得很清楚，它是一种属于光的物质，所以在破瓦法等很多修法中，都会将中脉观想为一根明亮的管子，但这种物质不是类似于构造出人体的血肉骨骼之类的物质，医生的手术刀无法接触到，X光等等也无法看到。
法性中脉：即位于存在中脉里面的一根更细微的光构成的中脉。也是修行人修行的真实对境。法性中脉具备四种特点：1、不占据空间；2、是一种光；3、当人活着的时候，由于气、脉、明点都具足，那时它也存在，不是不存在（非无）；4、当人死亡之后，人的气、脉、明点解散消亡，它也就消失无踪了，所以它也不是有（非有）。
此处所说的光，并不是物理学中所讲的可见光、不可见光等等，在任何一个光谱上，都找不到它的位置。纵然目前的医学与科技已经十分发达，在人体结构、细胞学等很多领域，都有了长足的进步，但迄今为止，不要说中脉等深层次的结构，连大脑的奥秘目前的科技都没有探索清楚。我们不能愚蠢地认为，凡是光，就必须包含于目前科学已经发现的光的种类当中；凡是物质，就必须肉眼能看见。
胜义中脉：胜义中脉实际上不是什么物质意义上的脉，而是心的本性。中观称之为空性，三转法轮称之为如来藏光明，密法称之为中脉。
为什么称此三者叫中脉呢？首先，因为存在中脉位于身体的正中，所以叫做中脉；而法性中脉处于存在中脉当中，故也叫做中脉；胜义中脉则因为不堕有无、常断等任何边际，故而称为中脉。
脉轮在密法的很多书里讲得很清楚，故此处暂时不介绍。
明点
胜义明点：明点以一个圆圈表示，象征远离一切边际。因为圆圈不像三角形、四方形、五角形等有棱有角、有边际的形状，它完全没有任何棱角，借以形容无有戏论，远离边际的心的本性如来藏光明，这叫做胜义明点。
气当中的部分智气，中脉里面的胜义中脉以及明点当中的胜义明点，都是指光明如来藏，所以，最深层次的气、脉、明点，都是指万法之源光明如来藏。所有气、脉、明点的源头，都是光明如来藏，从光明如来藏当中，产生了气、脉、明点、佛的刹土与不清净的轮回。
世俗明点：在人的脉轮当中，有很多明点。这些明点是维持人的生命、健康、思维等一切的基础。
在法性中脉的心口位置，有一个明点，称为五聚精华明点。五种精华，是指地、水、风、火、空五种精华。在五种精华的中间，是心的精华——如来藏。
气、脉、明点都是组成人体的重要部分，所有气、脉、明点的本质，都是光明如来藏。